Mir sind folgende "nervige" Bugs aufgefallen:
1) Fast dauerhafte Warnung, dass im Zoo zu viel Müll ist trotz genügend Mitarbeiter und einigen an Mistkübeln. Man kann das umgehend in dem man übertrieben viele Mistkübel aufstellt.
2) Verstärkt Probleme bei gemischten Tierarten in einem Gehege.
Folgende Probleme treten dabei verstärkt auf: Futterproblem, teilweise, werden dann 1-2 Tierarten gefüttert und die anderen verhungern daneben.
Die Tiere die laut Zoopedia zusammenpassen haben unterschiedlichste Ansprüche an die Landschaft, wodurch man große Probleme hat es allen Tieren in dem Gehege wirklich recht zu machen - meist ist es dann nur ein Mittelweg.
In den Tiergehegen wo mehrere Tierarten sind, kommt das Personal bei der Sauberkeit des Geheges nicht nach - ständig Meldungen, dass das Gehege verschmutzt ist (was hier noch öfters auftritt wie bei einem Gehege wo nur eine Tierart vorhanden ist).
3) Mehrere Wasserstellen im selben Gehege werden als Wasserplatz bei der Tieranzeige nicht summiert.
4) Tierbabys flüchten teilweise aus Gehege die "Ausbruchsicher" sind. 
5) Großes Problem mit den Transportboxen.
Die Tiere werden teilweise nicht aus ihren Transportboxen rausgeholt.
Manchmal besteht auch der Fehler, dass Tiere automatisch in eine Box kommen, obwohl sie sich innerhalb ihres Geheges und ihrer Umzäunung aufhalten.
6) Nach einigen Stunden Spielzeit bekam ich etliche Gebäudewarnungen, wo man selber kaum etwas tun kann und die Techniker sobald gleichzeitig über 15 Gebäude Probleme aufweisen auch nur zuschauen. Mit dieser Meldung plagt man sich dann Stunden - teilweise hilft dann nur ein abreißen und erneut bauen.
7) Höher gelegene Futterstellen werden nicht befüllt (z.B.: beim Affengehege) - hier ist es mir noch überhaupt nie gelungen, dass die Futterstelle gefüllt wird.
8 ) Der bei mir fatalste Fehler, dass die Tiere reihenweise verdursten, obwohl überall Wasserleitungen und fast überall noch zusätzlich saubere Wasserbereiche angelegt worden sind. Das Problem habe ich bis jetzt nicht in den Griff bekommen - teilweise stirbt eine ganze Tierart im Zoo.
9) Sehr auffällig (und teilweise wirklich störend - da so oft) sind auch die Warnhinweise, dass bei mir häufig alle Wasser- und Stromkraftwerke gleichzeitig ausfallen, was die Techniker jedes Mal komplett überfordert und sie teilweise vor den Kraftwerken stehen bleiben, aber den Fehler nicht beheben. Hier hilft teilweise sehr viele weitere Techniker einzustellen.
10) Manchmal bleibt auch Personal "stecken". Mir ist das bei einem Tierarzt vor der Tierklinik passiert, was als Auswirkung hatte, dass die anderen Tierärzte sich dahinter anstellten und nichts weiter ging.
11) Bei zwei Gästegebäuden fehlt die automatische Straßenanbindung ( Planet Zoo, Laden, groß, Planet zoo, Laden, klein)
12) Während der Beta-Phase ist es mir zweimal passiert, dass Planet Zoo "mit Auswirkungen" abgestorben ist, danach ging der Zoo nicht mehr zum Öffnen (auch keine vorherige Version), was jedes Mal einen Neuaufbau meiner Zoos bedeutete.
13) Nach Bau der Bahn sofortiger Performanceverlust.
Wenn man beim Schieneneditor auf automatisch vervollständigen geht, kann es sein, dass das System eine massiv lange Zeit berechnet ...
