Traurigerweise ist es genau so wie Gassenhauer schreibt.
GameStar hat einen längeren Artikel der mit der Maxis-Behauptung aufräumt, dass SimCity eine hochkomplexe Simulation sei bei der tausende von individuellen Sims berechnet würden etc. Die Spieler wurden da schlichtwegs (und einmal mehr) von Maxis / EA belogen.
Du wirst feststellen, dass die Gebäude ohne Arbeiter in der Regel diejenigen sind, die am weitesten vom Wohngebiet weg sind. Eben weil der Weg dahin am längsten ist.
In deinem Fall könnte das Problem noch damit zu tun haben, dass du lauter Technikstufe 2 Fabriken hast (weil du eine Hochschule hattest), nun aber Technikstufe 3 Arbeiter (weil Universität). Evt. müssen die Fabriken sich da erst auf Stufe 3 upgraden, damit das wieder passt (bin mir aber nicht sicher, evt. können Stufe 3 Arbeiter auch in Stufe 2 Fabriken arbeiten.)